Dans certains cas, il peut être avantageux d’utiliser des techniques de sous-typage moléculaire pour mieux identifier des sous-groupes ou des clusters (regroupements) de souches à l’intérieur d’un sérotype particulier, comme les O149:F4(K88) ou O157:H7. La technique utilisée au EcL est l’électrophorèse à champs pulsés (pulse-field gel electrophoresis; PFGE), couramment appelée le pulsetyping. Le pulsetyping est très discriminatoire, et par conséquent très utile dans les études de surveillance épidémiologique pour retracer la source des souches tout en respectant la période et la distribution géographique. Il permet également de suivre les isolats entre différents cas épidémiques, les fermes, la nourriture, les sources environnementales et les individus. De plus, le pulsetyping pourrait être utile pour analyser les liens entre les isolats de différentes sources dont le sérotype O ne peut être identifié. Le EcL utilise le protocole standard du CDC (Centers for Disease Control and Prevention ). Nos patrons de PFGE des isolats O157:H7 peuvent donc être comparés à ceux du PulseNet.
|
Épidémiologie moléculaire
|
|
Prix
|
50 $* par souche
|
|
Délai
|
2 à 3 semaines
|
